Το πρόβλημα λύθηκε. Επανέφερα το jumper για την τροφοδοσία του Pro Mini μέσω του FTDI στα 5V. Το είχα στον αέρα καθώς είχα πρόβλημα όταν ήταν έτσι. Μυστήρια πράγματα...